Фильм охватывает тысячу лет и рассказывает несколько историй о любви, смерти и хрупкости человеческого бытия.
Параллельно развиваются три никак не связанные между собой повествовательные линии. Конкистадор Томас прибывает в земли майя в поисках таинственного Древа жизни — только найдя его, он сможет помочь португальской королеве Изабелле удержаться на троне. Врач-онколог Томми отчаянно ищет лекарство от рака, который на глазах съедает его прелестную жену Иззи. Астронавт Том летит в прозрачном шаре, в центре которого растет живое дерево, к далекой туманности под названием Шибальба, и сопровождает его в этом путешествии лишь ворох воспоминаний и надежд...